Sino Biological 社SARS-CoV-2スパイク変異タンパク質

すべてのウイルスはゲノム突然変異によって進化が促進されます。突然変異によりウイルスは免疫応答から逃れ、ウイルス感染における選択的優位性を獲得します。ロスアラモス国立研究所の近年の研究によって、ヨーロッパ諸国で最初に出現したSARS-CoV-2 スパイクタンパク質の重要な突然変異 (D614G) が同定されました。このD614G変異株は、ヨーロッパ諸国で急速に感染の勢いを増していることから、D614G変異によってSARS-CoV-2ウイルスはより高い感染伝播力をもつ可能性が示唆されています。そのため、特にワクチンや医薬品の設計といった観点から、この変異株について理解することは極めて重要になります。

Sino Biological社は、D614G変異を有するリコンビナントS1タンパク質(40591-V08H3) を開発しました。リコンビナント614G変異株は、ACE2結合活性を示しました。

D614G変異に加えて、いくつか他の変異も同定されています。その変異の中には、S1のACE2と結合する能力を高めると考えられているものもあります。Sino Biological社では、これらの変異株の研究を促進するために、変異RBDタンパク質のパネルを開発しました。

最近、デンマーク政府は1700万匹のミンクを殺処分すると発表しました。その理由は、デンマークの国立血清研究所(SSI)がミンクから新たなSARS-CoV-2変異株を発見し、その変異株はミンクと人間の間で感染が広がる可能性があることがわかったためです。これまでに200以上の農場で感染が確認されています。

その変異の一つは、オランダのミンクにも見られるSARS-CoV-2 スパイク RBDのY453F変異です。Y453はRBDの保存されたアミノ酸で、ACE2の34Hと直接結合します (ミンクでは34Y)。Y453F変異はヒトACE2への親和性を高めるため、ミンクのACE2への適応的突然変異である可能性があります。この新しいSARS-CoV-2スパイク変異が中和抗体の認識能を低下させる可能性があることが研究によって明らかになりました。新たに開発されたSARS-CoV-2ワクチンは、この変異に対して感受性が低い可能性があります。

Sino Biological社は、Y453F変異 (40592-V08H80) を持つリコンビナントRBDタンパク質をわずか9日で開発しました。リコンビナントY453F変異株はACE2結合活性を示しました。

英国では最近、SARS-CoV-2の異なる株が出現し、ロンドンでの新規感染の60%以上を占めていると報告されています。CDCはこの変異株を「SARS-CoV-2 VOC (variant of concern) 202012/01」と命名し、その臨床的重要性を強調しています。

新たに同定されたB.1.1.7系統は非常に多くの遺伝子変異を持ち、その結果、前例のない14のAA置換を生じています。それらの変異のうち8つはスパイクタンパク質に発生し、以下の3つは特に重要な変異です。
N501Y, ヒトおよびマウスのACE2受容体への結合親和性の増加をもたらすと報告されています。
— 69-70del, 飼育下のミンクに関連した感染から発生した欠失です。
— P681H, Furinによる開裂部位に近接しています。

また、B.1.1.7株を、以前に同定された変異発生頻度の高い変異株とともに監視することも重要です。変異発生頻度の高い変異株として以下の例が挙げられます。
D614G, 感染伝播力がやや増加する可能性があります。
N439K, いくつかの中和抗体の“エスケープ変異体”である可能性があります。
Y453F, いくつかの中和抗体の“エスケープ変異体”である可能性があります。

Sino Biological社は、これらの変異株に対するリコンビナント抗原のコレクションを生産してきました。これらの試薬は、抗体の有効性の評価やワクチン接種に使用することができます。

SARS-CoV-2 スパイク変異タンパク質商品リスト

Catalog # Product Name
40592-V08H82 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (N501Y) NEW
40592-V08H80 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (Y453F) NEW
40591-V08H3 SARS-CoV-2 Spike S1-His tag (D614G)
40592-V08H46 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (S477N)
40591-V02H3 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike S1(D614G), ECD-Fc Recombinant Protein
40589-V08H4 SARS-CoV-2 Spike S1+S2 ECD tag (R683A, R685A, F817P, A892P, A899P, A942P, K986P, V987P)
40592-V08H7 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (K458R)
40592-V08H6 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (F342L)
40592-V08H1 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (V367F)
40592-V05H1 SARS-CoV-2 Spike RBD-mFc tag (V367F)
40592-V08H2 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (N354D)
40592-V08H4 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A435S)
40592-V08H5 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (V483A)
40592-V08H9 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (W436R)
40592-V08H8 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (G476S)
40592-V08H10 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (R408I)
40592-V08H11 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (V341I)
40592-V08H12 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (Y508H)
40592-V08H14 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (N439K)
40592-V08H15 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (V503F)
40592-V08H16 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A522V)
40592-V08H18 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (S494P)
40592-V08H19 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A372S)
40592-V08H20 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A520S)
40592-V08H21 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A522S)
40592-V08H22 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (D405V, Q414A)
40592-V08H23 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (Q414E)
40592-V08H24 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (P384L)
40592-V08H25 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A348S)
40592-V08H26 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (F338L)
40592-V08H27 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (F377L)
40592-V08H28 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (L452R)
40592-V08H29 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (P521S)
40592-V08H30 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (T478I)
40592-V08H31 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (V483I)
40592-V08H32 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (S359N)
40592-V08H33 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (K378R)
40592-V08H34 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (Q409E)
40592-V08H35 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (I472V)
40592-V08H36 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A372T)
40592-V08H37 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A344S)
40592-V08H39 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A520V)
40592-V08H40 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (E406Q)
40592-V08H41 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (F490S)
40592-V08H42 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (K378N)
40592-V08H43 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (N370S)
40592-V08H44 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (Q414R)
40592-V08H45 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (S477I)
40592-V08H47 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (T385A)
40592-V08H48 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (T393P)
40592-V08H49 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (V395I)
40592-V08H52 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (G485S)
40592-V08H53 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (G482S)
40592-V08H54 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (K444R)
40592-V08H55 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (N440K)
40592-V08H56 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (E471Q)
40592-V08H57 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (P479S)
40592-V08H58 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (A352S)
40592-V08H59 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (K417N)
40592-V08H62 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (P337S)
40592-V08H63 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (P521R)
40592-V08H64 SARS-CoV-2 Spike RBD-His tag (S477R)